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完整的测序过程步骤 全基因组测序有哪三种方法?

浏览量:2943 时间:2023-06-25 14:45:09 作者:采采

全基因组测序有哪三种方法?

三种方法:基因组装、全外显子测序(W

ngs二代测序的常用方法?

焦磷酸测序、合成测序、连接测序和离子半导体测序。

第二代DNA测序技术的操作流程?

操作过程如下:

1.测序文库的构建

首先制备基因组,然后将DNA随机断裂成几百个碱基或更少的小片段,并在两端加入特殊的接头。如果是转录组测序,文库的构建相对麻烦。RN段化后,需要反向转化为cDNA,然后加入接头,或者先将RNA反向转化为cDNA,再将片段加入接头。

2.锚泊桥

Solexa测序反应是在一个被称为流动池的玻璃管中进行的,这个玻璃管被细分为八个泳道,每个泳道的内表面有无数个固定的单链头。将上述步骤中获得的具有接头的DN段变性为单链,然后与测序通道上的接头引物结合,形成桥结构,用于随后的预扩增。

3.前置放大

加入未标记的dNTP和普通Taq酶进行固相桥PCR扩增,将待检测的单链桥片段扩增为双链桥片段。通过变性,互补的单链被释放并锚定在附近的固体表面。通过不断循环,在流动池的固体表面将获得数百万簇待检测的双链片段。

4.单碱基延伸测序

将四种荧光标记的dNTP、DNA聚合酶和接头引物加入测序的流动池中进行扩增。当每个测序簇延伸其互补链时,每个荧光标记的dNTP可以释放相应的荧光。测序仪捕捉荧光信号,通过计算机软件将光信号转换成测序峰,从而获得待测片段的序列信息。

5.数据分析

严格来说,这一步可以 t不能算作排序操作流程的一部分,但只有通过这一步的前期工作才有意义。测序得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列。应该通过生物信息学工具将这些短序列组装成重叠群甚至全基因组的框架,或者将这些序列与现有的基因组或相似物种的基因组序列进行比较,并进行进一步分析,以获得有生物学意义的结果。

片段 测序 序列 基因组 接头

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