c++教程 kegg分析结果怎么用?
kegg分析结果怎么用?KEGG一般采用条形图、点图或棒棒糖图显示。转录组数据中如何找GO富集分析上下调基因?如何从转录组测序数据判断KEGG富集的意义?提取样品总RNA后,用带有oligo(DT)的
kegg分析结果怎么用?
KEGG一般采用条形图、点图或棒棒糖图显示。
转录组数据中如何找GO富集分析上下调基因?
如何从转录组测序数据判断KEGG富集的意义?提取样品总RNA后,用带有oligo(DT)的磁珠富集真核细胞mRNA(对于原核生物,用试剂盒去除rRNA,然后进行下一步)。
添加片段缓冲液以将mRNA破碎成短片段。以mRNA为模板,用随机六聚体合成第一条cDNA链。然后加入缓冲液、dNTPs、rna酶H和DNA聚合酶I合成第二条cDNA链,用qaquick法合成第二条cDNA链,纯化PCR试剂盒,加入EB缓冲液洗脱,末端修复,A+DNA测序,琼脂糖凝胶电泳选择片段大小。最后进行PCR扩增,并用Illumina HiSeq 2000对测序文库进行测序。
go和kegg富集分析有什么作用?
Go和KEGG富集分析主要是研究差异表达基因的功能鉴定,从而探讨不同操作的生物学意义。